研究人员首次成功模拟hiv成熟过程的关键步骤 -米乐体育官方

发布时间:2015-12-31     浏览次数:
西班牙imim研究所及庞培法布拉大学(pompeu fabra university,upf)的生物信息学家已利用分子模拟技术来解释hiv病毒粒子成熟过程的每一个具体步骤,例如,新形成的惰性病毒颗粒如何成为感染性病毒,这对于了解病毒

    西班牙imim研究所及庞培法布拉大学(pompeu fabra university,upf)的生物信息学家已利用分子模拟技术来解释hiv病毒粒子成熟过程的每一个具体步骤,例如,新形成的惰性病毒颗粒如何成为感染性病毒,这对于了解病毒复制至关重要。该项研究已在线发表于《美国国家科学院报》(pnas)。相关研究成果可能对未来抗逆转录病毒药物的设计非常重要。
    hiv病毒颗粒成熟并变得具有感染性,是一种名为hiv蛋白酶的蛋白作用结果。这种蛋白的作用就像一把剪刀,剪断连接蛋白的长链,使新形成的hiv病毒颗粒具有感染性的结构。根据imim-upf计算生物物理小组,整个hiv病毒成熟过程中最引人瞩目的方面之一是,如何释放hiv蛋白酶,例如,这种剪刀蛋白的首次出现,因为它最初也是组成新hiv病毒粒子的长聚蛋白链的一部分。
    利用acemd的一个分子模拟软件及技术,该研究小组已经证明,首个剪刀蛋白可从内聚蛋白连的中间切断自身,它们是通过结合其n端至自身的激活位点,随后切断它们与其余链之间的化学键。这是整个hiv成熟过程的初始步骤。如果hiv蛋白酶能在成熟过程中被中止,将能够阻止病毒颗粒的成熟及变得具有传染性。
    该项工作利用gpugrid.net开展,这是一个自愿分布式计算平台。研究人员利用这种强大的计算能力来处理大量的数据,并生成高度复杂的分子模拟。
    研究人员称,hiv病毒成熟过程中的这一发现,为未来利用这些新分子机制的药物设计奠定了基础。当前,这项工作提供了对hiv生命周期一个关键步骤的更深入了解。
 

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